Tras la tercera fase de construcción y uso del megalito el registro indica, por el momento, un largo periodo de abandono de la Cobertoria, hasta llegar a períodos históricos: en concreto, a la época moderna-contemporánea. Es ahí donde detectamos una serie de alteraciones en el monumento que podríamos vincular a actividades de expolio de la tumba.
La posible existencia de tesoros en el lugar motivó diversos accesos a la estructura prehistórica que supusieron modificaciones sustanciales de las ruinas originales que están siendo objeto de investigación (y publicación), ya que suponen una fase histórica más que vuelve a demostrar la larga pervivencia del sitio de la Cobertoria en la memoria, en las leyendas y también en la Historia del territorio de Mallecina.
